Сергей Владимирович Арцыбашев в 1982 году окончил Первый Московский ордена Ленина и ордена Трудового Красного Знамени медицинский институт имени И. М. Сеченова (в настоящее время Первый Московский государственный медицинский университет имени И.М. Сеченова).

В 1983 году он окончил интернатуру данного института на базе Факультета глазных болезней имени Краснова в Московской городской офтальмологической клинике.

С 1983 по 1984 год проходил специализацию в качестве врача-офтальмолога в Муниципальной поликлинике города Москвы.

В 1984 году доктора Арцыбашева пригласили на работу в Московский научно- исследовательский институт микрохирургии глаза под руководством академика Святослава Федорова, и он начал работать в отделе рефракционной хирургии и проводить операции по методике радиальной кератотомии.

С 1986 по 1987 год работал в Международном отделе Института микрохирургии глаза. С 1987 года стал работать в Институте Федорова в Отделе пересадки роговицы под руководством профессора Валентины Копаевой. Также в этом отделе, на базе кафедры усовершенствования врачей III медицинского университета имени Семашко, оперировал и преподавал иностранным и отечественным офтальмологам метод радиальной кератотомии. Среди обучающихся были группы врачей в т.ч. из Венесуэлы, Испании, Италии, Китая, Сирии.

В Институте Федорова д-р Арцыбашев занимался научными разработками в хирургии при таких заболеваниях, как кератоконус, астигматизм после пересадки роговицы и при артифакии.

В июле 1988 года институт отправил его в командировку в Италию для преподавания методики радиальной кератотомии глазным хирургам из Италии и Сан-Марино, и для проведения показательных операций.

Он работал в Институте микрохирургии глаза академика Федорова до 1990 года.

С 1990 года он продолжал оперировать в Будапеште, в одном из частных глазных учреждений.

В апреле 1994 года доктор Арцыбашев открыл собственную офтальмологическую клинику в Будапеште на горе Геллерт, уникальная и в международном масштабе известная специализация которой с 2015 года позволила зарегистрировать в ЕС и носить название Кератоконусного центра Арцыбашева.

В мае 2007 года д-р Арцыбашев Сергей стал действительным членом Украинской Академии Наук.